Невдовзі він зазнав нападок з усіх політичних сторін після катастрофічних перших місяців війни, коли Німеччина, здавалося, була готова до швидкої перемоги. Не маючи змоги самостійно сформувати національний уряд, він пішов у відставку в травні 1940 року після провалу британських спроб звільнити Норвегію.
Після провалу британської експедиції до Норвегії в квітні 1940 року Чемберлен втратив підтримку багатьох консерваторів у Палаті громад. Він пішов у відставку 10 травня, в день німецького вторгнення в Нідерланди.
Потім Чемберлен шокував уболівальників Warriors, сказавши, що думає піти на пенсію. Він був втомився від подвійної чи потрійної команди та від того, що команди виконують жорсткі персональні фоли проти нього. Він також висловлював постійний страх, що одного разу може втратити самовладання.
Визнавши, що національний уряд, підтриманий усіма основними партіями, є необхідним, Чемберлен пішов у відставку з прем'єрства оскільки лейбористська та ліберальна партії не будуть працювати під його керівництвом. Хоча він все ще очолював Консервативну партію, його наступником на посаді прем'єр-міністра став його колега Вінстон Черчилль.
Чемберлен загинув у листопаді 1940р; однак його продовжували ганьбити за умиротворення в цілому та за його дії у вересні 1938 року зокрема ще довго після його смерті та завершення війни.
Майже напевно, так. «Я не можу не любити Вінстона, хоча я вважаю, що він майже завжди помиляється і неможливий як колега». Чемберлен і Черчилль вперше працювали разом у 1924–1929 роках, коли вони обидва були міністрами кабінету в уряді Стенлі Болдуіна, і співпрацювали над кількома реформами.