Що означає FASTA в біології?

опис. FASTA — це текстовий формат біоінформаційних даних, який використовується для зберігання послідовностей нуклеотидів або амінокислот (наприклад, дезоксирибонуклеїнової кислоти [ДНК] або рибонуклеїнової кислоти [РНК]). Кожен файл може зберігати одну або кілька послідовностей. FASTA вимовляється як "Fast A" ("fast-aye"), оскільки назва є скороченням "ШВИДКО-Все".

Обидва BLAST (Базовий інструмент пошуку локального вирівнювання) і FASTA (швидко все) використовуються для пошуку збігів подібних послідовностей бази даних. Показано, що обидва програми працюють однаково добре, за винятком кількох відмінностей.

FASTA можна використовувати в вирівнювання послідовностей для визначення областей подібності. Це корисно для ідентифікації консервативних ділянок у ДНК або білкових послідовностях, що може допомогти ідентифікувати функціональні домени або мотиви.

У біоінформатиці та біохімії формат FASTA є текстовий формат для представлення нуклеотидних послідовностей або амінокислотних (білкових) послідовностей, у якому нуклеотиди або амінокислоти представлені за допомогою однолітерних кодів. Формат дозволяє назви послідовностей і коментарі передувати послідовностям.

Файли FNA, зокрема, можуть використовуватися для зберігання лише інформації про нуклеїнову кислоту, тоді як інші формати FASTA містять іншу інформацію, пов’язану з ДНК, наприклад із розширенням FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET або AA.

FAST-All FASTA — це текстовий формат біоінформаційних даних, який використовується для зберігання послідовностей нуклеотидів або амінокислот (наприклад, дезоксирибонуклеїнова кислота [ДНК] або рибонуклеїнова кислота [РНК]). Кожен файл може зберігати одну або кілька послідовностей. FASTA вимовляється як "Fast A" ("fast-aye"), оскільки назва є скороченням "ШВИДКО-Все".