Мета: Починаючи з послідовності, визначте білок або ген і джерело. Порівняння послідовності білків і генів виконується за допомогою BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). На вкладці «Вирівнювання» поруч із пунктом «Перегляд вирівнювання» виберіть «Попарно з крапками для тотожності»..
Три основні методи створення парних вирівнювань: матричні методи, динамічне програмування та методи Word; однак методи вирівнювання кількох послідовностей також можуть вирівнювати пари послідовностей.
Попарне вирівнювання та множинне вирівнювання є основними інструментами для порівняння послідовностей. BLAST — це програма біоінформатики, яка найчастіше використовується для порівняння вашої власної послідовності (послідовності запиту) з усіма послідовностями в базі даних (суб’єктними послідовностями) на основі локального парного вирівнювання.
Попарне вирівнювання в Geneious Prime Подібно до точкової діаграми, попарне вирівнювання — це порівняння між двома послідовностями з метою визначення того, які регіони двох послідовностей пов’язані спільним походженням, а які регіони послідовностей були піддані вставкам, видаленням і замінам.
Визначте вхідні параметри: перерахуйте всі відповідні вхідні параметри, важливі для тестування. Визначте значення параметрів: визначте можливі значення для кожного параметра, щоб охопити широкий спектр сценаріїв. Створення попарних комбінацій: використовуйте інструменти для створення тестів, які систематично охоплюють усі пари вхідних параметрів.