Розділи мікробіології можна розділити залежно від типу досліджуваних організмів та їх ролі. Основні гілки включають вірусологія, бактеріологія, мікологія, протозоологія, фікологія, паразитологія та нематологія.
очищення води; мікробіологічне дослідження; біологічне розкладання відходів; екологія. Забруднення та псування; поширення захворювань.
Існує п’ять основних мікробіологічних лабораторних процедур (п’ять «я»), які використовуються мікробіологами для дослідження та характеристики мікробів, а саме Інокуляція, інкубація, ізоляція, інспекція (спостереження) та ідентифікація.
Мікробіологія складається з кількох субдисциплін, зокрема: бактеріології (вивчення бактерій), мікології (вивчення грибів), фікології (вивчення водоростей), паразитології (вивчення паразитів) і вірусології (вивчення віруси та як вони функціонують усередині клітин) [1].
Ця галузь прикладної мікробіології далі підрозділяється на різні галузі, такі як Геомікробіологія, біоремедіація, мікробна екологія, мікробне різноманіття та кругообіг поживних речовин, опосередкований мікробами.
Мікробіологія має застосування в різних галузях промисловості, в тому числі фармацевтична промисловість, виробництво продуктів харчування та напоїв, сільське господарство, управління навколишнім середовищем, енергетика та переробка відходів. Він також використовується в галузях, зосереджених на генній інженерії та біотехнології.