Усі еукаріоти мають три різні РНК-полімерази (РНКП), які транскрибувати різні типи генів. РНК-полімераза I транскрибує гени рРНК, РНК-полімераза II транскрибує гени мРНК, мікроРНК, snRNA і snoRNA, а РНК-полімераза III транскрибує гени тРНК і 5S рРНК.
Еукаріотичні клітини містять три різні ядерні РНК-полімерази, які транскрибувати різні класи генів (Таблиця 6.1). Гени, що кодують білки, транскрибуються РНК-полімеразою II, утворюючи мРНК; рибосомальні РНК (рРНК) і транспортні РНК (тРНК) транскрибуються РНК-полімеразами I і III.
РНК-полімераза I є ферментом, який транскрибує рибосомні РНК. РНК-полімераза II – це фермент, який транскрибує попередники мРНК. РНК-полімераза III – це фермент, який транскрибує тРНК. Він транскрибує всі рРНК, крім компонента 5S рРНК.
Полімерази α, δ і ε найбільш активні в клітинах, що діляться, що свідчить про їхню реплікацію. Навпаки, полімераза β активна в клітинах, що не діляться та клітинах, що діляться, що свідчить про те, що вона може функціонувати головним чином у відновленні пошкоджень ДНК.
ДНК-полімераза I функціонує для заповнення прогалин ДНК, які виникають під час реплікації, відновлення та рекомбінації ДНК. ДНК-полімераза II також бере участь у редагуванні та вичитуванні, головним чином, у відстаючому ланцюзі (Kim et al. 1997, Wagner and Nohmi 2000). ДНК-полімераза III є основним реплікативним ферментом.
РНК-полімераза (Pol) I виробляє рибосомну (r)РНК, важливий компонент механізму синтезу клітинного білка, який стимулює ріст клітини, що лежить в основі багатьох фундаментальних клітинних процесів.